让它们内战失败的脑灵。决定直接侵略它们。
于是，后面的战争就展开了，而在战争之前，队长就开始了避难所的建造计划，这个计划，最初被认为是不可能实现的，或者被认为没有任何用处，甚至脑灵侵略也一度被认为是荒谬之事。
但是，队长十分地坚持，为了实行这个计划，进行了许多方面的努力。
最后，它们总算说服了大部分的阿特兰，开始建造地下避难所计划。
曾经被封锁已久的地下，又再度打开了，阿特兰在世界各地的地下建造起了避难所，避难所有着统一的编号，并且能容纳数千阿特兰在里面居住。
但是阿特兰的数量太多。。避难所的数量不够，这就意味着，有相当多的阿特兰无法进去。
它们，只能在在脑灵的轰鸣之下，阿特兰的城市灰飞烟灭……但也有许多的阿特兰们隐藏到了地下，它们依赖着避难所立的生活用品活了下去。
这也包括当初的队长，它继续指挥着，联络着各个避难所，维持着整体的生活。。…。
这些避难所都被预定为数十年之后便开放，让里面的居民离开。
但是，这个过程被延迟了。
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