明朝自从设立南赣以来，一直安排巡抚大员坐镇，稳定地方，最出名的应该是王阳明任职南赣巡抚时期，他剿抚并用，打击作恶的首犯。
王阳明为了约束南赣地区的民众，搞了一套“相约制度”，约束民众的行为。
设置“约”以及“约长”等职务，定期聚会，共同处理地方问题，并且建立社学、书院教化当地百姓，推动了南赣地区的发展。
王阳明的这一套做法为后来者做出了模板，南赣地区的形势逐步改变，安定下来。
南赣巡抚设立之初，以“赣州为治所，兼理南安、赣州、建昌三府，及广东之潮、惠、南雄，福建之汀州，湖广之郴州等处捕盗事宜”。
此后该职辖区不断盈缩变化，但大致还以赣州府、南安府为中心，其余辖区则以“兼辖”管理。
嘉靖三十五年时，福建汀、漳二府被划入南赣巡抚治下，不过同属南赣和福建双重管理。
但是，毕竟汀、漳二府长期接受福建管理，所以在出现广东饶贼在闽地作乱后，第一时间上报的还是福建巡抚，倒是让南赣巡抚躲过了这次灾祸。
朝廷授予俞大猷的南赣副总兵一职，其实就是统帅的南赣巡抚手下的兵马，毕竟这些人马因长期剿贼尚保有一些战力，但长期各自为战，缺乏一名大将统御。
俞大猷的到来，倒是让他们有了主心骨，在这次围剿张琏一战中颇有收获。
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