蒋经国认为：「古宁头战役是国民党的转折点。」胡琏说：「古宁头战役的胜利既是军事上的，也是政治上的，更是JiNg神上的。」
认为因为解放军在古宁头战役惨败，加上11月3日登步岛战役，使解放军对登陆战艰钜有深刻了解，解放军积极加强建设海空力量，不像过去单靠陆军登陆作战。
东南军政长官陈诚谓之：「是共军渡江以来碰到的第一个大钉子。」而中华民国代总统李宗仁特以此捷，於重庆致电陈诚申贺，谓：
特急，台北陈长官辞修兄：
金门守军奋勇应战，予以重刽，捷报传来，人心振奋，吾兄董督有方，将士用命，至足佩慰。希即传令嘉奖，查明有功将士，呈报国防部，分别奖赏，并盼再接再厉，晋建殊勳，无任企望。
李宗仁
1949年11月3日，蒋在「敌我双方优势之分析」的训词中，曾说：
「此次金门保卫战的结果，对於来犯之匪万余人，予以彻底的歼灭，不使有一人脱逃漏网，这是我们剿匪以来最大的一次胜利。」
其後，於1950年4月，特别颁发团T荣誉旗，以奖参与此役特着功绩之第一一八师及第十八师。
鉴於古宁头战役惨败，在第四野战军发动海南岛战役前，专门发电报要求四野向第三野战军调查渡海作战经验，以免重蹈金门覆辙。
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